近日,中国科学院国家纳米科学中心孙佳姝团队联合北京大学药学院、中国人民解放军总医院第五医学中心、北京大学口腔医院等,开发了基于凝集素糖类分子识别的热泳生物传感新方法,实现了血浆中细胞外囊泡(EV)聚糖图谱的快速、高灵敏、选择性分析,并用于三阴性乳腺癌(TNBC)精准诊断、疗效监测与预后预测。相关研究成果以Thermophoretic glycan profiling of extracellular vesicles for triple-negative breast cancer management为题,发表在《自然-通讯》(Nature Communications)上。
TNBC是指雌激素受体、孕激素受体、人表皮生长因子受体-2均为阴性的乳腺癌亚型。相比于其他乳腺癌亚型,TNBC恶性程度更高、预后更差。由于缺乏特异性生物标志物,TNBC的临床诊疗手段有限。EV携带的聚糖在肿瘤演进中发挥重要作用,作为新型肿瘤生物标志物具有潜力。由于体液环境复杂、EV异质性强,以及传统糖类分析方法复杂繁琐、灵敏度不足,血液样本中的EV聚糖图谱测量面临挑战。
该研究发展了基于凝集素糖类分子识别的EV聚糖热泳分析新方法(EVLET)。研究采用荧光修饰的凝集素特异性标记血浆中EV的表面聚糖,通过振动膜过滤去除未结合的凝集素、可溶性糖蛋白和脂蛋白等干扰物质,进一步利用微流控热泳富集EV并放大与其偶联的凝集素荧光信号,实现了EV聚糖的高灵敏、定量检测,且灵敏度比基于凝集素的ELISA高2个数量级。针对TNBC,研究结合生物信息学与实验手段筛选出一组特异性凝集素探针,利用EVLET获取临床血浆EV聚糖图谱。基于机器学习算法构建EV聚糖特征,研究实现了TNBC精准诊断,且准确率达到91%。在TNBC疗效监测方面,EV聚糖特征对疾病进展或缓解的判断准确率达到96%,并可作为TNBC患者无进展生存期的独立预后因素。上述成果为基于EV聚糖图谱检测的非侵入性癌症管理提供了新方法。
研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、中国科学院稳定支持基础研究领域青年团队计划、中国博士后科学基金以及中国科学院青年创新促进会等的支持。