二欠投入和政策
目前我国的仪器研发经费是不足的，而且还很不均衡，因此“钱”必然长期困扰仪器研发工作。
我们应该注意到，除了直接投入，目前用在采购仪器上的钱，有一部分实际会间接用到研发上，因为如果国内的科研院所都能花比较多的钱用于采购国产的新型科研仪器，就可以使国产科研仪器的创新—研发—销售形成一个顺畅的良性循环，如能让企业乐于投入大笔的经费在研发环节，这样研发和生产的队伍也容易稳定，自然会对创新非常有利。
因此，在科研仪器采购的经费安排上，也应有适当的政策鼓励科研院所采买国产仪器，虽然这些国产仪器在技术指标上尚不能全面和国外进口仪器抗衡，但是却在使用、维护和维修方面要比进口仪器便利和便宜得多。
为了搞好原创性的科研仪器研发，项目主管部门应该把仪器自主研发成果作为科研项目的重要考核指标之一，各单位在制定员工考评和奖励制度时，应该明确新仪器开发和改进方面工作量的计算标准及相应的奖励规格，这样才能鼓励员工积极参与科研仪器的研发。
三欠基础和能人
国产科研仪器研发根基尚浅，基础薄弱。这一方面源于我国在基础材料和加工技术方面比较落后，这种落后影响到了包括仪器仪表行业在内的整个工业技术领域。主要表现在常用的基础材料和器件的质量不够好，虽然可凑合着用在普通的民用技术中，但用于高端的研究型仪器，则很难保证其技术指标能够达到科学研究的要求;有时虽可以通过“优中选优”选出最合适的材料和器件，但成本太高很难被产业化大量生产和使用。
另一方面的基础薄弱，是指理论基础。目前做仪器研发的人主要是工程技术人员，他们在理论水平方面通常低于那些需要使用仪器做研究的科学家，对一些与仪器研发相关的重要的科学原理没有吃透或掌握不全面，难以对仪器的相关原理真正做到融会贯通，因而难以迅速形成新的设计。此外，由于大学的分科教育体制，很多研究和技术开发人员的知识面不够宽，也影响了他们对仪器的研发能力的提升。
而做仪器研发，有些能人是必不可少的。首先要有基础扎实、立足于科学前沿、对所涉足领域的科学问题非常清楚的一批高素质、有实践经验的人作为设计师，他们要知道目前急需的研究手段和实验技术，能提出原创性的解决方案，并善于整合资源实现设计。随后，还要有能工巧匠做出好用的、具有自主知识产权的原创国产科研仪器。当然，这些能人都不是天生的，需要长时间的仪器研发工作去培养和锻炼，研发团队也需要不断的磨合。
四欠核心和深度
我国对科研仪器研发的介入深度不够，经常是浅尝辄止。由于全新原理的原创科研仪器的价值通常不容易迅速被人所认识，因此靠新仪器打开市场赚钱较难。从事仪器研发和生产的单位更习惯于生产、改进和销售那些在市场上受欢迎的仪器，包括以往市场份额大、口碑好的老型号仪器和对这些老型号仪器做小的改进，通过提高数字化和自动化程度、增加部分功能、改进外观设计等方式来获得用户青睐。这种小修小改的“研发”远远无法达到原创的级别，只是这样做便于赚钱，所以不少科研仪器的研发生产单位乐此不疲。
目前我国很多仪器的核心部件实际是进口国外产品。这种利用产自不同国家的零部件进行组装生产仪器的状况在全球化时代虽属正常现象，但其中有一些根本没有掌握核心技术，却仍自我标榜为“具有自主知识产权”的国货精品，则完全是掩耳盗铃、自欺欺人。
五欠信心和人气
